Struktūra

Fakulteto taryba yra aukščiausioji fakulteto savivaldos institucija. Jos nutarimai privalomi visiems fakulteto darbuotojams ir studentams.  

Fakulteto dekanė - dr. Loreta Skurvydaitė.

Prodekanai:
Akademinių reikalų ir tarptautinių ryšių prodekanas - dr. Norbertas Černiauskas
Mokslo reikalų ir plėtros prodekanas - doc. dr. Salvijus Kulevičius

Istorijos fakultetą sudaro 4 katedros:
Archeologijos, vedėjas prof. Albinas Kuncevičius
Istorijos teorijos ir kultūros istorijos, vedėjas prof. Alfredas Bumblauskas
Naujosios istorijos, vedėjas prof. Arūnas Streikus
Senovės ir viduramžių istorijos, vedėjas prof. Rimvydas Petrauskas

Fakultete veikiantis  Kultūrinių bendrijų studijų centras priklauso Istorijos teorijos ir kultūros istorijos katedrai (vadovas doc. dr. Grigorijus Potašenko),  o Lietuvos statutų ir Lietuvos metrikos tyrimų grupė (vadovė prof. Irena Valikonytė) Senovės ir viduramžių istorijos katedrai.